La estación de Ayerbe fué inaugurada el 1 de junio de 1893 con la puesta en marcha del tramo Huesca-Jaca de la línea que uniría más tarde  Zaragoza con la frontera francesa por Canfranc. Aunque dicho tramo fue abierto y explotado desde un primer momento por Norte la concesión inicial había recaído en la Sociedad Anónima Aragonesa la cual cedió la misma a Norte.
En 1941, pasó a manos de Renfe.
Desde el 31 de diciembre de 2004 Adif es la titular de las instalaciones.
Su aspecto exterior es de piedra natural y sus dimensiones sólo las comparte con la estación de Jaca. Época de origen: II. Subsiste en la actualidad aunque en no muy buen estado.